本學院為國內研究水域生物相關科技與學術最為完整且具有特色的教學與研究學府,具有完整的水域資源與生物原料生產基礎科學與技術,以及海洋生物培育、利用、加工及生物科技應用科學與技術。自106學年度起,本學院包括食品科學系、水產養殖學系、生命科學暨生物科技學系、海洋生物科技學士學位學程、海洋生物研究所、食品安全與風險管理研究所、海洋生物科技博士學位學程等3學系2獨立所2學位學程。